La Secretaría de Recursos Hídricos comenzó a funcionar como tal el 7 de abril de 2004, luego que se aprobara el 18 de marzo de ese año la Ley 2.092, que modificó la Ley de Ministerios y estableció la creación del organismo, con el impulso del por entonces gobernador Carlos Verna. Esta misma impronta siguió en los gobiernos posteriores de Oscar Mario Jorge, Verna y Sergio Ziliotto.
El 7 de abril de 2004 asumió como secretario de Recursos Hídricos Juan Pablo Morisoli; Carlos Schulz como director de Investigación Hídrica; Néstor Lastiri como director de Políticas Hídricas; y Miguel Demateis como secretario privado, dando inicio así a la Secretaría de Recursos Hídricos, iniciativa que otorgó al Gobierno provincial una dependencia dedicada a profundizar las políticas relacionadas con los recursos hídricos y su defensa. La creación de la Secretaría respondió a una necesidad estratégica para la planificación temporal y territorial de los recursos hídricos provinciales, con el objetivo de aprovecharlos de manera eficiente y equitativa para el desarrollo de todas las comunidades, sin importar su tamaño. Esta medida fue de suma importancia como política de Estado, especialmente en un contexto donde la provincia enfrenta una crisis hídrica y debe defender los ríos interprovinciales que atraviesan su territorio. La Secretaría de Recursos Hídricos se ha convertido en una herramienta vital para la defensa de este recurso esencial y escaso para los habitantes de La Pampa. Acto Para conmemorar estos 20 años, la Secretaría de Recursos Hídricos llevará a cabo este lunes, a las 9.30, en el Centro Cultural MEDASUR un acto para reconocer a ex secretarios y al personal que trabajó durante los primeros años. Serán distinguidos Juan Pablo Morisoli (fue secretario entre 2004 y 2007), Javier Schlegel (2015-2019) y Néstor Lastiri (2007-2011, 2011-2015 y 2019-2023). También habrá distinciones para Hugo Bonett, Armando Capello, Walter Cazenave, Miguel Demateis, Natalia Francia, Gastón Giambelli, Roxana González, Raúl Hernández, Norma Irasset, María Alejandra Mac Allister, Viviana Martínez, Valeria Massimelli, Patricia Matalón, Carina Morales, Carla Moscardi, Pamela Pratts, Carlos Schulz, Darío Vancetti y Enrique Zabala. Y se les entregará un reconocimiento a los familiares de Miguel Marusich, Armando “Tucho” Rodríguez, Néstor “Negro” Gallego y Alfredo “Morcilla” Grandón. El cierre estará a cargo de la cantante Laura Paturlanne.